Community
impact
Помимо диагностических тест-систем, мы создаем программные инструменты, полезные биологам, биоинформатикам
и медицинским генетикам.
Код программ доступен под свободной лицензией на GitHub.
Также мы участвуем в образовательном процессе
совместно с Институтом биоинформатики: весной 2017 года создали курс на образовательной платформе Stepik и регулярно поддерживаем интенсивы в летних и зимних Школах биоинформатики.
и медицинским генетикам.
Код программ доступен под свободной лицензией на GitHub.
Также мы участвуем в образовательном процессе
совместно с Институтом биоинформатики: весной 2017 года создали курс на образовательной платформе Stepik и регулярно поддерживаем интенсивы в летних и зимних Школах биоинформатики.
Подробнее
Геномный браузер Concentrate
Concentrate — новый бесплатный инструмент для визуализации геномных данных. В браузере используется новый подход визуализации данных и их фильтрации
с помощью логических единиц на основе классического отображения информации, сгруппированной в треки.
Демоверсия.
Документация на GitHub wiki, лицензия GNU Affero General Public License v3.0.
Постер, представленный на конференции ISMB/ECCB 2017.
с помощью логических единиц на основе классического отображения информации, сгруппированной в треки.
Демоверсия.
Документация на GitHub wiki, лицензия GNU Affero General Public License v3.0.
Постер, представленный на конференции ISMB/ECCB 2017.
Курс «Управление вычислениями» на Stepik
Онлайн-курс, созданный совместно с Институтом биоинформатики на образовательной платформе Stepik, посвящен изучению инструментария для работы
с данными и автоматизации анализа.
Дедлайнов нет, все лекции и задачи доступны для свободного прохождения, решения проверяются автоматически. Курс входит в онлайн-программу «Анализ данных».
Ссылка на курс.
Подробнее о курсе на нашем сайте.
с данными и автоматизации анализа.
Дедлайнов нет, все лекции и задачи доступны для свободного прохождения, решения проверяются автоматически. Курс входит в онлайн-программу «Анализ данных».
Ссылка на курс.
Подробнее о курсе на нашем сайте.
СONVector
Программа для поиска структурных вариантов в данных таргетного секвенирования,
который позволяет проводить поиск делеций и инсерций.
Новый метод и инструмент на его основе подробно описан в статье в BMC Bioinformatics.
Код находится в открытом доступе (лицензия GNU GPL 2.0), описание в GitHub.
Постер, впервые представленный на конференции MCCMB.
который позволяет проводить поиск делеций и инсерций.
Новый метод и инструмент на его основе подробно описан в статье в BMC Bioinformatics.
Код находится в открытом доступе (лицензия GNU GPL 2.0), описание в GitHub.
Постер, впервые представленный на конференции MCCMB.
SeqDB LOVD
SeqDB LOVD — общедоступная специализированная база данных, которая содержит информацию о клинической значимости вариантов в гене CFTR.
База создана Parseq Lab совместно с Медико-генетическим научным центром (МГНЦ, Москва)
и курируется профильными специалистами.
Ресурс помогает российским врачам-генетикам
в интерпретации результатов генетического тестирования на муковисцидоз, проводимых как методом высокопроизводительного анализа генома (MPS/NGS),
так и обычными тест-системами.
База рекомендована Российским Национальным консенсусом «Муковисцидоз: определение, диагностические критерии, терапия» [Капранов Н.И. и др., 2016].
Подробнее об истории создания ресурса читайте
на нашем сайте.
База создана Parseq Lab совместно с Медико-генетическим научным центром (МГНЦ, Москва)
и курируется профильными специалистами.
Ресурс помогает российским врачам-генетикам
в интерпретации результатов генетического тестирования на муковисцидоз, проводимых как методом высокопроизводительного анализа генома (MPS/NGS),
так и обычными тест-системами.
База рекомендована Российским Национальным консенсусом «Муковисцидоз: определение, диагностические критерии, терапия» [Капранов Н.И. и др., 2016].
Подробнее об истории создания ресурса читайте
на нашем сайте.
Контакты
Parseq Lab
+7 (812) 243-11-90
дорога в Каменку, 74А
Санкт-Петербург, 197350
info@parseq.pro
http://parseq.ru
Parseq Lab
+7 (812) 243-11-90
дорога в Каменку, 74А
Санкт-Петербург, 197350
info@parseq.pro
http://parseq.ru
