Участие в конференции The Human Identification Solutions (HIDS): Innovations and Perspectives 2016, Барселона

Научный сотрудник компании Parseq Lab Надежда Пильщикова участвовала с постером «Применение высокопроизводительного секвенирования для работы над сложными случаями в экспертной криминалистике» («Massively parallel sequencing application to forensic expert level casework»), посвященный результатам работы над 11 практическими случаями криминалистической экспертизы, анализ которых с применением традиционных молекулярно-генетических методов оказался безуспешным. Важно отметить, что применение технологии высокопроизводительного секвенирования позволило в 9 случаях из 11 сделать значимые выводы, которые были использованы в заключении экспертов и направлены в суд.

Для работы над этими случаями мы использовали панели VariFindTM HID assay и секвенирование на Ion PGM. Результаты работы показали, что технологии высокопроизводительного секвенирования (NGS/MPS) позволяют эффективно дополнить традиционные молекулярно-генетические методы, оказываясь особенно эффективными для работы со сложными случаями в криминалистической экспертизе. К таким, трудным для классических методов, случаям относятся образцы с высоко-деградированной ДНК, смешанные образцы и образцы с малым количеством ДНК. Примеры из каждой группы были представлены среди анализируемых образцов.

Применение технологии высокопроизводительного секвенирования в каждом случае имеет свои преимущества: в смешанных образцах решающий фактор — это возможность увеличения покрытия секвенируемых участков, для образцов с деградированной ДНК ключевой является возможность использования панелей с короткими ампликонами сопоставимой длины, а в случаях с малым количеством ДНК для анализа – использование панелей с большим количеством локусов.

Решение VariFindTM HID assay создано научными сотрудниками, биоинформатиками и программистами компании Parseq Lab. Мы продолжаем совершенствовать продукт совместно с коллегами из молекулярно-генетических криминалистических лабораторий.

Решение включает набор реагентов, специализированное программное обеспечение и ИТ-инфраструктуру для безопасного хранения и эффективного анализа данных. Решение организовано по модульному принципу, основные модули позволяют реализовывать такие сценарии анализа, как идентификация личности, определение этногеографического происхождения и предсказание фенотипических признаков.

Подробнее об использовании высокопроизводительного секвенирования для идентификации личности читайте на странице, посвященной проекту.