К основному контенту
ПОДДЕРЖКА
О КОМПАНИИ
Программное обеспечение
Подготовка NGS библиотек
Кастомизированные NGS панели
HLA-типирование
Онкология
Выделение ДНК и РНК
Медицинские изделия
OncoScope™ Software выполняет анализ данных высокопроизводительного секвенирования, контроль качества, аннотирование и классификацию генетических вариантов по AMP/CAP и AСMG. Программное обеспечение развернуто в облаке и не требует собственных вычислительных мощностей пользователя.
Инфраструктура располагается на территории РФ и соответствует требованиям ФЗ № 152 «О персональных данных» от 27.07.2006 г.

OncoScope™ Software Программное обеспечение

Доступ к программному обеспечению OncoScope™ Software предоставляется бесплатно при покупке панелей OncoScope™
Программное обеспечение для работы с данными, полученными на тест-системах OncoScope™. Не требует биоинформатической подготовки пользователя.
Простой рабочий процесс
1

Импорт данных и метаинформации

Загрузка FASTQ и run info

2

Анализ и контроль качества данных

Выравнивание на референсный геном;

Подсчет метрик качества;

Идентификация вариантов;

Анализ покрытия;

Анализ хотспотов;

Анализ BIDs.

3

Аннотация и визуализация

Номенклатура HGVS;

Определение экзона;

Аллельная фракция;

Частота варианта по аккаунту;

Ссылки на внешние базы данных dbSNP, ClinVar, COSMIC и прочие;

Встроенный геномный браузер

4

Интерпретация. Проприетарная база VariScope

ACMG значимость;

AMP уровень;

Чувствительность к препаратам;

Ссылки на источники.

5

Генерация отчета

Гибко настраиваемые шаблоны отчетов;

Выгрузка данных bam, bai, vcf, bed, tsv.

Пайплайн DualStream
Функции программного обеспечения
Программное обеспечение
Подготовка NGS библиотек
Кастомизированные NGS панели
HLA-типирование
Онкология
Выделение ДНК и РНК
Медицинские изделия