Содержит реагенты для приготовления библиотек и доступ к программному обеспечению OncoScope™ Software для анализа данных.

OncoScope™ NSCLC Solution

Не для диагностических целей

Тест-система для определения маркеров чувствительности или устойчивости к лекарственным препаратам при немелкоклеточном раке легкого (NSCLC).

Комплексное готовое решение

Реагенты для подготовки библиотек

Пайплайн

Программное обеспечение OncoScope™ Software

Основные параметры

Двухстадийный протокол пробоподготовки

ДНК и РНК анализируются одновременно

Валидированный пайплайн и ПО для анализа данных

Варианты аннотированы по AMP/ASCO/CAP и ACMG

Результат за 24 часа для 16 образцов

Спецификация

Параметр

Значение

Количество генов в панели

23

Детектируемые варианты

по ДНК: SNV, INDEL
по РНК: EXLOSS, FUSION

Ограничения

Набор не предназначен для детекции CNV, протяженных STR и гомополимерных вариантов

Время до получения результата

24 часа для 16 образцов

Тип таргетного обогащения

Мультиплексная ПЦР

Режим прочтения

Парные риды (PE) 150 + 150

Биологический идентификатор (BID)

Включен

ПО для анализа

OncoScope™ Software
Пайплайн DualSteam
База аннотаций VariScope

Входящий материал

ДНК и РНК, выделенные из тканей, фиксированных формалином и заключенных в парафин (FFPE)

Длина таргетных регионов ДНК

9 135 п.н.

Рекомендуемое количество прочтений на образец

500 000

Совместимые платформы

MiSeq™, MiSeq Dx™, NextSeq™

Анализируемые гены и заболевания

Параметр

Значение

Анализируемые участки ДНК

Все кодирующие последовательности ДНК (CDSs) генов EGFR, KRAS, TP53, NRAS;
20-25 экзоны гена ALK;
11 и 15 экзоны гена BRAF;
16-21 экзоны гена ERBB2 (HER2);
2, 8, 10, 21 экзоны гена PIK3CA;
хотспоты генов MET и ROS1

Анализируемые транслокации

Транслокации генов с указанием гена-партнера для транслокаций между перечисленными генами и без указания генов-партнеров для всех остальных вариантов.
Онкогены: NTRK1, NTRK2, NTRK3, ALK, ROS1, RET.
Гены-партнеры: AKAP13, IRF2BP2, SQSTM1, TRIM24, ETV6, TPM3, EML4, CD74, KIF5B

Детектируемые делеции экзонов

Делеция 14 экзона гена MET;
делеция 16 экзона гена ERBB2

Протокол пробоподготовки

Для заказа

Набор реагентов OncoScope™ NSCLC Solution для детекции вариантов, ассоциированных с НМРЛ методом высокопроизводительного секвенирования (RUO). Вариант исполнения - set 1,
96 реакций

Артикул: OS-L1-96RUO
Состав:

комплект реагентов для подготовки библиотек,
доступ к программному обеспечению OncoScope™ Software

Набор реагентов OncoScope™ NSCLC Solution для детекции вариантов, ассоциированных с НМРЛ методом высокопроизводительного секвенирования (RUO). Вариант исполнения - set 1-1,
16 реакций

Артикул: OS-L11-16RUO
Состав:

комплект реагентов для подготовки библиотек,
доступ к программному обеспечению OncoScope™ Software

Набор реагентов OncoScope™ NSCLC Solution для детекции вариантов, ассоциированных с НМРЛ методом высокопроизводительного секвенирования (RUO). Вариант исполнения - set 1-2,
16 реакций

Артикул: OS-L12-16RUO
Состав:

комплект реагентов для подготовки библиотек,
доступ к программному обеспечению OncoScope™ Software

Набор реагентов OncoScope™ NSCLC Solution для детекции вариантов, ассоциированных с НМРЛ методом высокопроизводительного секвенирования (RUO). Вариант исполнения - set 1-3,
16 реакций

Артикул: OS-L13-16RUO
Состав:

комплект реагентов для подготовки библиотек,
доступ к программному обеспечению OncoScope™ Software

Набор реагентов OncoScope™ NSCLC Solution для детекции вариантов, ассоциированных с НМРЛ методом высокопроизводительного секвенирования (RUO). Вариант исполнения - set 1-4,
16 реакций

Артикул: OS-L14-16RUO
Состав:

комплект реагентов для подготовки библиотек,
доступ к программному обеспечению OncoScope™ Software

Набор реагентов OncoScope™ NSCLC Solution для детекции вариантов, ассоциированных с НМРЛ методом высокопроизводительного секвенирования (RUO). Вариант исполнения - set 1-5,
16 реакций

Артикул: OS-L15-16RUO
Состав:

комплект реагентов для подготовки библиотек,
доступ к программному обеспечению OncoScope™ Software

Набор реагентов OncoScope™ NSCLC Solution для детекции вариантов, ассоциированных с НМРЛ методом высокопроизводительного секвенирования (RUO). Вариант исполнения - set 1-6,
16 реакций

Артикул: OS-L16-16RUO
Состав:

комплект реагентов для подготовки библиотек,
доступ к программному обеспечению OncoScope™ Software

Связанные продукты

Набор для выделения PureCode™ DNA/RNA Magnetic FFPE

Набор для одновременного выделения ДНК и РНК из тканей, фиксированных формалином и заключенных в парафин (FFPE), на магнитных частицах.

Подробнее