Содержит реагенты для приготовления библиотек и доступ к программному обеспечению VariFind™ Myeloid Software для анализа данных.
Solution
Myeloid
Тест-система для определения клинически значимых генетических вариантов в 27 генах при:
- Остром миелоидном лейкозе
- Миелодиспластических синдромах
- Миелопролиферативных новообразованиях
Из линейки продуктов VariFind™
Программное обеспечение
VariFind™ Myeloid Software
VariFind™ Myeloid Software
Исследуемые маркеры
В состав Myeloid Solution входит:
Набор реагентов
Экзоны 7-9
WT1
CDS
ZRSR2
CDS
TP53
TET2
CDS
CDS
STAG2
Экзоны 1-2, интрон 1
SRSF2
Экзоны 14-16
SF3B1
SETBP1
Экзон 4
CDS
RUNX1
Экзоны 2,3
NRAS
Экзон 11
NPM1
MPL
Экзон 10
Экзоны 2,3
KRAS
KIT
Экзон 17
Экзоны 12, 14
JAK2
Экзон 4
IDH2
Экзон 4
IDH1
GATA2
Экзоны 1-7, 5'-UTR
Экзоны 13-16, 20
FLT3
Экзоны 5-6, 14-18
EZH2
Экзоны 8-23
DNMT3A
CEBRA
Экзон 1
CDS
CBL
Экзон 9
CALR
CDS
BCOR
Экзоны 4-7,9
ABL1
ASXL1
Экзон 13
2
1
Программное обеспечение
VariFind™ Myeloid Software
VariFind™ Myeloid Software
Исследуемые маркеры
Набор реагентов
В состав Myeloid Solution входит:
2
1
Основные параметры
Валидированный пайплайн и ПО для анализа данных
Состав панели сформирован на основе актуальных клинических рекомендаций
Способен детектировать мутации FLT3-ITD
Допускает ручной анализ хотспотов гена U2AF1
Варианты аннотированы по AMP/ASCO/CAP и ACMG
Основные параметры
Валидированный пайплайн и ПО для анализа данных
Состав панели сформирован на основе актуальных клинических рекомендаций
Способен детектировать мутации FLT3-ITD
Допускает ручной анализ хотспотов гена U2AF1
Варианты аннотированы по AMP/ASCO/CAP и ACMG
Протокол пробоподготовки
Программное обеспечение
Программное обеспечение для работы с данными, полученными на тест-системах VariFind™ Myeloid Solution. Не требует биоинформатической подготовки пользователя.
Доступ к программному обеспечению VariFind™ Myeloid Software предоставляется бесплатно при покупке набора VariFind™ Myeloid Solution.
Алгоритм работы программного обеспечения
Технические характеристики набора
Параметр
Значение
Количество генов в панели
27
Количество реакций
48
Ограничения
Набор не предназначен для детекции CNV, протяженных STR и гомополимерных вариантов
Входящий материал
ДНК, выделенная из цельной крови и аспирата костного мозга
Длина таргетных регионов ДНК
54 344 п.н.
Минимальное количество прочтений на образец
825 000
Режим прочтения
Парные риды (PE) 150 + 150
Биологические идентификаторы (BIDs)
Включены
ПО для анализа
Включено